Происхождение многих древних пород покрыто тайнами и легендами. Справедливо это и для пекинеса.
По одной из легенд пекинес – это дитя любви льва и мартышки. Сердце могучего льва покорила маленькая обезьянка. Он попросил богов сделать его таким же маленьким, как и его возлюбленная, или забрать его жизнь. Боги, сжалившись над ним, исполнили просьбу. И родились у влюбленных дети: с телом, головой и гривой Льва и с лицом Мартышки, такие же храбрые и добрые, как отец, а умные и хитрые, как мать.
Другая легенда гласит, что пекинес происхождение ведет от драконов. Во время великой войны людей и драконов, один из драконов попросил богов уберечь его детей от истребления. И бог согласился помочь, поставив три условия: дракончики родятся маленькими и пушистыми, и их полюбят дети и женщины; во-вторых, они будут храбрыми и гордыми, и их будут уважать мужчины; а последнее условие – они не будут извергать огонь. Но когда через некоторое время бог пришел проведать дракончиков, то они решили показать ему, чему их научил дракон и стали извергать пламя. Вдруг пушистая шерсть вспыхнула от огня и горела до тех пор, пока не осталась только черная мордочка с грустными и большими от ужаса глазами.
Исторически же порода пекинес берет свои корни в Китае. Там она считалась Императорской собакой, и владеть ею могли только члены императорской семьи. Остальным же запрещалось ее содержание под страхом смертной казни. В услужении у собак были слуги, отвечающие за их здоровье и красоту. Но случались и кражи, таким путем представители редкой породы попадали к европейцам.
Пекинеса называют Львиной собакой Пекина. Его изображения можно увидеть на гравюрах и статуях, в храмах и дворцах. Они считались защитниками от злых духов, заменяя собой образ львов, почитаемый в буддизме.
Во время войны 1860 года англо-французская армия напала на Летний императорский дворец, и семья императора была вынуждена бежать. Одни исторические источники свидетельствуют о том, что императрица распорядилась истребить всех своих собак, чтобы они не попали в руки врага, и лишь пяти собакам удалось спастись, так как они спрятались под троном. Другие исследователи говорят о том, что одна из женщин императорской семьи осталась во дворце с собаками, решив покончить жизнь самоубийством, но осталась жива. В любом случае в ходе захвата дворца собаки попали к англичанам, а впоследствии были подарены королеве Виктории, а также герцогиням Веллингтонской, Ричмондской.